Allele Specific PCR法

 今日はネギアザミウマの合成ピレスロイド系殺虫剤に強い遺伝子を検出するためのAllele Specific PCR用のプライマーを設計して注文した.Allele Specific PCR(AS-PCR法)とはPCR用のプライマーは3'末端塩基が違うと増幅されないという原理を利用する方法である.これを利用してプライマーを設計すれば薬剤抵抗性だとバンドが出るようなPCRができる.Toda & Morishita(2009)でGenBankに登録されているAB499848.1TとAB499851.1Tを取り出しアライメントして任意の配列のプライマーを作成する.全部で4本作った.さっそく注文したので,来週には試すことができる.