2010-12-01から1ヶ月間の記事一覧
Rickettsiaの細胞培養がダメでした.原因はよくわからない.しかし,こうなることを予想して住化にミドリヒメをすでに注文しています.12月20日には来ますので再度系統を作出して,感染を確認し次第つくばに送ります.
ちゃんとコロニーができた. わかりにくいかもしれないが,ホワイトコロニーがちゃんと確認できる.インサートチェックはTaKaRaのちょー簡単を使うことにする.このキットは最初からTaq,ベクター用プライマーが入っており,後は25μl滅菌水を入れコロニーを…
本当はRNA抽出,RT-PCRまで今日する予定であったが,朝の出来事(まったくの私事というか他人事?)で時間的な余裕がなくなり断念.明日以降にすることになる.また,高知からIYSVのRNAが届いたのでこれもついでにRT-PCRをした後シーケンスする.シーケンス…
とりあえず,LB培地に塗布までは終了.明日の朝を祈るように待つだけである.植物防疫用の写真もかなり撮れた.
13日に近中四と中央農研でチーム検討会がある.なんで同じ日なんだろう???偶然,できすぎ.というわけでそれ用の書類をヒタスラ作成する.で,午後一でそれぞれの場所へお送りする.これで今年度分の作文はとうぶん何もすることはなくなる.
明日は鳥取産のIYSVを再度RT-PCRする予定である.
今日は再度Rickettsiaの細胞培養を作成する.今度は最初からカイコ細胞(BmN4)を使って行う.ハモグリミドリヒメコバチは静岡大学から送られてきたものである.上手くいきますように.
植物防疫にTAクローニングの記事を書くため神戸大学のMeterousという寄生蜂を題材にマイクロサテライト探索を行う.まず,マイクロサテライト用のプライマーで増やしたPCR産物とpGEM-T (Easy) Vector Systemsを混ぜ合わせる.これを1晩置く(本当は: pGEM-T …
1.ハモグリミドリヒメコバチのRickettsia細胞培養系再確立(蚊とカイコ細胞両方). 2.カイコのdsxプライマーを注文. 3.NKNさんのデータ処理. 4.なぜか13日に集中したものの書類作成とパワポ作成. 5.応動昆小集会用性決定論文チェック.
久しぶりに自分のしたいことに近いシンポに参加した.が,やっぱり興味とはちょっと違う.ただ,いろいろと仕事の話ができたのでわざわざ来た甲斐があった. しかし,どうやって遺伝子がぽこっと抜けるのだろうか? あと,早急にしなければいけないことがた…
明日明後日はつくば国際会議場でのBiology of Symbiosisに参加してきます.福山不在.
植継ぎの日をころっと忘れていた.
再度BLASTで検索して系統樹を描く. 周りにあるのはアメリカ西部産のIYSV.その上に過去に登録された日本産のIYSVがある.うーーー,何か予想とちょっと違う.
奥田ら(2005)を参考にIYSVのアライメントを行った.結果として奥田らが登録したシーケンスとよく似ていた.また,IYSV-NLとも似ていた.とりあえず,1系統しかないと考えネギアザミウマのプライマーを作成しよう.300bpから500bpぐらいで作る予定である.
BLASTで検索したらIris yellow spot virusがちゃんと出てきた.当たり前か・・・ただ,シーケンスの波形を見ていたら何となく重複している.やはり重複感染か?
来期の応用動物昆虫学会誌の編集委員を引き受けることにした.
このままシーケンス用サンプルが貯まるまでまっていたらいつになるかわからないので,6本でシーケンサーに今朝かけた.終わるのは10時半ぐらいかな.山口大学のYMST君お待たせ.IYSVもとりあえず終わり.
EXCELをお勉強しながらの作成.時間かかります.2007以降とその前とやり方変わりすぎ.
結局,ゲットできませんでした・・・まだ,早いんだろうね.来週木金でしよっと.
鳥取のYSDさんがIYSVを送ってくれた.さっそく,前回と同じプロトコールでRNA抽出,逆転写そしてPCRと進んだ.YSDさんありがとうございました. とりあえず データを −−−−−−−−−−−−−−−−−−−− ウイルス系統名: IYSV HR-0801 採取場所: 鳥取県東伯郡北栄町 宿…
今日も図表作り. 岡山大学のSM君,ポスターがんばってください.
今日は某論文の図表を仕上げるぞ!
ひょっとしたらPCRとかDNAシーケンスとかは難しいのかもしれないと最近思ってきた.そういえば,おとつい「ちょーお手軽」培地を注文した.私を含め素人に毛が生えた人にはやはりプレミックス,カラムや最初からの出来合い(ゲル,TAEなどなど)を使うことが…