Allele Specific PCR (AS-PCR)

　Thrips tabaciネギアザミウマのアライメントしたものをプライマーを設計するために眺めた．配列を見て一番良いプライマーデザインはPCRで産雌性単為生殖系統だったら3本，産雄性単為生殖系統だったら2本のバンドが出るものである．しかし，これだとやったら3本になる．
　今回は，薬剤抵抗性ともからめるために他の手段を考えている．それがAllele Specific PCRである．PCRはプライマーの3'末端塩基が違うと増幅されないそうだ．これを利用してプライマーを設計すれば薬剤抵抗性だとバンドが出るようなPCRができる．で，生殖の系統分けもこれでしようかと考え中．
　ただ，とりあえず，どちらでも分けられるようなプライマーを設計して注文した．チェックは来週以降だろうなーー．そろそろ国際シンポの用意もしなければいけないし．