とりあえず，MEGA5でNJ法を使ってIYSVの系統樹を作った．Out GroupはTSWVである．この系統樹から見えることはまず非常に某地方のIYSVはアメリカ西部産に近い．次になぜかブラジルでくくられる．門外漢なので検討会で専門家によって教示してもらおう．

今日は定例の植継ぎの日．

MacBook Air 11インチ欲しい！

今日は水道から水が出ない．凍って破裂したそうだ．しかし，なぜか私のいる部屋の水道から水が出る．？？？管が違うのだろうか？？？

全然でなかった鳥取産と高知産のIYSVをRandom Primer pd(N)6を使って再度挑戦．前回はoligo dT primerを使っていたため出なかっただろうと仮定． ちなみにこれらのプライマーは pd(N)6はN（何でも塩基OK）が6個（配列そのものに相補）．oligo dT primer（pd(…

というように Encarsia formosaのPI Wolbachiaはかろうじて感染している．たぶん，まだ植継ぎ頃ではないのでしょうね．Rickettsiaは相変わらず元気．

感染チェックのPCRを行う．

PLoS Oneからreviewerの依頼がきた．CI Wolbachiaのモデルである．お引き受けします．1月25日が〆切って．で，アメリカ昆虫学会やら某国昆虫学会のも今週中にはお返しします．

今日はRickettsiaとE. formosaのPI Wolbachiaの植継ぎを行った．

昨日は山口大学のYMST君が来福．シロアリの系統樹をあれこれ．

この間，見回りに「部屋を片付けなさい」と指摘された．今日，某氏の論文を英文校閲に出したのと空の薬瓶を捨てに行かなければいけないので，えいやっと大掃除？をした．自分ではきれいになったつもりであるが，荷物を右から左に移動しただけかもしれない． …

結局， のようにRickettsiaもPI Wolbachiaもしっかり細胞培養されていた．

非破壊でDNAを抽出した標本をもって**へ行きます．

Rickettsia，Wolbahcia，通常の植継ぎの日．

で，愛媛のIYSVもシーケンスが終わった．高松のIYSVに近かった．

今朝，5時半からシーケンスにかけた結果 CAAGCTATGCATCCAACGCGTTGGGAGCTCTCCCATATGGTCGANCTGCAGGCGGCCGCGAA TTCACTAGTGATTGGGGCAG GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG というような「GT」の反復配列…

某プロジェクトの成績書および某部会の提出エクセル書類も送付する．

ひたすら某氏論文の英語を書き続ける．

朝からシーケンスをかけに行ったが，シーケンサーが動いていてだめだった；；しょうがないから次のシーケンス用のサンプルを作る．9:00すぎにシーケンサーにかける．

今日と明日はネギアザミウマ，IYSVおよびMeterousのマイクロサテライトのシーケンスを行う． このブログに書くべき事ではないが，福山って寒いけれど晴れているんだよね．松江で育った人間にとってこれはすごいことである． さて，今日もがんばろう．

Rickettsiaは感染していたが，PI Wolbachiaはダメみたい．

非破壊でのDNA抽出実験の続き． Chelex2時間は1/8，12時間は6/8および24時間は3/8でバンドがでた（分子はバンド出現数，分母は調査個体数：プライマーはDNAバーコード用のLCOIとHCOI）．時間と漬かっている容量の問題？バンドの有無と破壊程度には関係がある…

PCR，講習，管理調査，本年度の研究成果，発生予察プロの研究成果，某氏論文のカキコ・・・

2011年3月の応動昆では 「マルチプレックスPCR法によるネギアザミウマの系統識別」 という講演申込みを行った．これは本ブログでも紹介しているマルチプレックスPCR法による単性生殖系統と両性生殖系統の識別方法についてである．この方法で意外と圃場での混…

昨年からしている非破壊によるDNA抽出実験をする．どうもchelexのボイルによって腹部が壊れると山口のHGSUR君が言うもんで再度chelexのボイル時間と標本の状態を調べることに．しかし，本当にEncarsia formosaの同定形質として腹部って重要なの？

通常の植継ぎ，Rickettsiaの植継ぎおよびEncarsia formosaのWolbachiaの植継ぎ終了．RickettsiaとWolbachiaは感染チェック．

本年もよろしくお願いいたします．私の正月は完全休養＆ビールでした．昨日重たい荷物を持って腰が痛くなり立ったり座ったりするのに難儀な日々です．